GMT 4.5.18 在 Linux 下的安装

说明

本文介绍如何在 Linux 下编译 GMT4 的最新版也是最终版本：GMT 4.5.18。

下载

官方 ftp：ftp://ftp.soest.hawaii.edu/gmt
国内镜像：http://mirrors.ustc.edu.cn/gmt/

需要下载的包包括：

注：GMT 中的 triangulate 命令有两个不同的源码，其中一个遵循 GPL 协议，另一个不遵循 GPL 协议。GMT 的 src 包中包含了前者。若有特殊需求，需要使用后者源码的功能，可以下载 gmt-4.5.18-non-gpl-src.tar.bz2 ，并将解压后的 triangulate 源码覆盖 gmt-4.5.18-src.tar.bz2 中的相应源码。

下载完成后，可以用 md5sum 检查压缩文件的 md5 值，以保证该文件是完整且未被篡改的:

$  md5sum gmt-4.5.18-src.tar.bz2 gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz
b35cf18fddcf4823dc75b1ea32808d71  gmt-4.5.18-src.tar.bz2
8ee2653f9daf84d49fefbf990bbfa1e7  gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz

依赖关系

基础依赖包

编译 GMT 时需要一些开发工具（ gcc 、 g++ 和 make ）以及底层的库文件 libc.so 和 libm.so 。

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt update
sudo apt install gcc g++ make libc6
sudo apt install ghostscript

对于 CentOS/RHEL/Fedora:

sudo yum install gcc gcc-c++ make glibc

netCDF 库

GMT4 主要依赖于 netCDF4，可以直接使用 Linux 发行版官方源中提供的 netCDF 包。除了 netCDF 之外，建议还安装 gdal 包。虽然 GMT 不依赖于 gdal，但 gdal 可以轻松地将其他数据格式转换为 GMT 可识别的格式。

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt update
sudo apt install libnetcdf-dev libgdal-dev python-gdal

备注： libgdal-dev 在某些版本的 Ubuntu 下叫 libgdal1-dev

对于 RHEL/CentOS/Fedora:

sudo yum install netcdf netcdf-devel gdal gdal-devel gdal-python

注意：

一定不要试图自己手动编译 netCDF。如果在阅读本文之前曾经手动编译过，一定要将原来手动编译生成的文件删除干净。通常可以使用 locate netcdf 找到 /usr/local 目录下的与 netCDF 相关的文件，直接删除即可。
CentOS 和 RHEL 的官方源中没有 netCDF，需要首先添加 EPEL 源再安装 netCDF；Fedora 官方源中自带 netCDF；

X 相关库

GMT4 中的 xgridedit 命令是一个很简易的带 GUI 的网格文件编辑器，其依赖于一堆图形界面相关库文件:

libICE.so   libSM.so   libX11.so  libXaw.so
libXext.so  libXmu.so  libXt.so

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt update
sudo apt install libxaw7-dev
sudo apt install libice-dev libsm-dev libx11-dev
sudo apt install libxext-dev libxmu-dev libxt-dev

对于 CentOS/RHEL/Fedora:

sudo yum install libXaw-devel
sudo yum install libICE-devel libSM-devel libX11-devel
sudo yum install libXext-devel libXmu-devel libXt-devel

安装 GMT

编译 GMT 源码

$ tar -xvf gmt-4.5.18-src.tar.bz2
$ cd gmt-4.5.18
$ ./configure --prefix=/opt/GMT-4.5.18
$ make
$ sudo make install-all       # 注意：这里是 install-all 不是 install

其中 --prefix 指定了 GMT 安装路径，你可以指定为其他路径，但要注意后面其他步骤要与这里的路径统一。

安装海岸线数据

$ cd ../
$ tar -xvf gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz
$ sudo mv gshhg-gmt-2.3.7 /opt/GMT-4.5.18/share/coast

修改环境变量

向 ~/.bashrc 中加入 GMT4 的环境变量，并使环境变量生效：

$ echo 'export GMT4HOME=/opt/GMT-4.5.18' >> ~/.bashrc
$ echo 'export PATH=${GMT4HOME}/bin:$PATH'>> ~/.bashrc
$ echo 'export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:${GMT4HOME}/lib64'>> ~/.bashrc
$ exec $SHELL -l

说明：

第一个命令向 ~/.bashrc 中添加环境变量 GMT4HOME
第二个命令修改 ~/.bashrc ，将 GMT4 的 bin 目录加入到 PATH 中
第三个命令将 GMT4 的 lib 目录加入到动态链接库路径中，若为 32 位系统，则为 lib ；64 位系统则为 lib64
第四个命令是重新载入 bash，相当于 source ~/.bashrc

命令测试

在终端键入 psxy - ，若出现如下输出，则安装成功:

$ psxy -
psxy 4.5.18 [64-bit] - Plot lines, polygons, and symbols on maps

个人笔记

查看 GMT 需要哪些动态链接库:

$ cd /opt/GMT-4.5.18/bin
$ readelf -d * | grep 'Shared library' | sort -u

Ubuntu 下查找哪个软件包提供某个特定库文件： http://packages.ubuntu.com/
CentOS 下查找哪个软件包提供某个特定库文件： yum provides libICE.so.6

修订历史

2013-11-07：针对 GMT 4.5.11 发布初稿
2014-03-02：针对 GMT 4.5.12 进行更新
2014-03-08：make install->make install-all
2014-07-10：更新 gshhg 为 2.3.1 版；GMT4 不依赖 gdal
2014-09-14：更新 gshhg 为 2.3.2 版
2014-09-26：Ubuntu 下 libxaw-dev 应为 libxaw7-dev
2014-10-14：修正了若干细节
2014-11-04：修改环境变量 LD_LIBRARY_PATH
2015-01-01：更新至 GMT 4.5.13
2015-09-06：推荐安装 GDAL 的 Python 绑定（内含 gdal_merge.py ）
2015-09-18：下载后检查压缩文件的 md5 值
2015-10-11：重新整理了软件的依赖关系
2015-11-01：更新至 GMT 4.5.14
2016-10-07：更新至 GMT 4.5.15 和 GSHHG 2.3.6
2018-01-02：更新至 GMT 4.5.17 和 GSHHG 2.3.7
2018-07-05：更新至 GMT 4.5.18

文章目录

说明

下载

依赖关系

基础依赖包

netCDF 库

X 相关库

安装 GMT

编译 GMT 源码

安装海岸线数据

修改环境变量

命令测试

个人笔记

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