说明

本文介绍如何在 Linux 下编译 GMT4 的最新版本:GMT 4.5.17。

很多 Linux 发行版的源中带有 GMT 软件包,但是版本一般较老,因而这里假定想要自己编译 GMT4 的读者,下载和编译的都是 GMT4 的最新版本,因而本文会随着 GMT4 新版本的发行而不断作出修改。

下载

需要下载的包包括:

注:GMT 中的 triangulate 命令有两个不同的源码,其中一个遵循 GPL 协议,另一个不遵循 GPL 协议。GMT 的 src 包中包含了前者。若有特殊需求,需要使用后者源码的功能,可以下载 gmt-4.5.17-non-gpl-src.tar.bz2 ,并将解压后的 triangulate 源码覆盖 gmt-4.5.17-src.tar.bz2 中的相应源码。

下载完成后,可以用 md5sum 检查压缩文件的 md5 值,以保证该文件是完整且未被篡改的:

$  md5sum gmt-4.5.17-src.tar.bz2 gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz
1d6f9d927e5334e30407171e16d8831f  gmt-4.5.17-src.tar.bz2
8ee2653f9daf84d49fefbf990bbfa1e7  gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz

依赖关系

基础依赖包

编译 GMT 时需要一些开发工具( gccg++make )以及底层的库文件 libc.solibm.so

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt-get update
sudo apt-get install gcc g++ make libc6

对于 CentOS/RHEL/Fedora:

sudo yum install gcc gcc-c++ make glibc

netCDF 库

GMT4 主要依赖于 netCDF4,可以直接使用 Linux 发行版官方源中提供的 netCDF 包。除了 netCDF 之外,建议还安装 gdal 包。虽然 GMT 不依赖于 gdal,但 gdal 可以轻松地将其他数据格式转换为 GMT 可识别的格式。

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt-get update
sudo apt-get install libnetcdf-dev libgdal-dev python-gdal

备注: libgdal-dev 在某些版本的 Ubuntu 下叫 libgdal1-dev

对于 RHEL/CentOS/Fedora:

sudo yum install netcdf netcdf-devel gdal gdal-devel gdal-python

注意:

  1. 一定不要试图自己手动编译 netCDF。如果在阅读本文之前曾经手动编译过,一定要将原来手动编译生成的文件删除干净。通常可以使用 locate netcdf 找到 /usr/local 目录下的与 netCDF 相关的文件,直接删除即可。
  2. CentOS 和 RHEL 的官方源中没有 netCDF,需要首先添加 EPEL 源再安装 netCDF;Fedora 官方源中自带 netCDF;

X 相关库

GMT4 中的 xgridedit 命令是一个很简易的带 GUI 的网格文件编辑器,其依赖于一堆图形界面相关库文件:

libICE.so   libSM.so   libX11.so  libXaw.so
libXext.so  libXmu.so  libXt.so

对于 Ubuntu/Debian:

sudo apt-get update
sudo apt-get install libxaw7-dev
sudo apt-get install libice-dev libsm-dev libx11-dev
sudo apt-get install libxext-dev libxmu-dev libxt-dev

对于 CentOS/RHEL/Fedora:

sudo yum install libXaw-devel
sudo yum install libICE-devel libSM-devel libX11-devel
sudo yum install libXext-devel libXmu-devel libXt-devel

安装 GMT

编译 GMT 源码

$ tar -xvf gmt-4.5.17-src.tar.bz2
$ cd gmt-4.5.17
$ ./configure --prefix=/opt/GMT-4.5.17
$ make
$ sudo make install-all       # 注意:这里是 install-all 不是 install

其中 --prefix 指定了 GMT 安装路径,你可以指定为其他路径,但要注意后面其他步骤要与这里的路径统一。

安装海岸线数据

$ cd ../
$ tar -xvf gshhg-gmt-2.3.7.tar.gz
$ sudo mv gshhg-gmt-2.3.7 /opt/GMT-4.5.17/share/coast

修改环境变量

~/.bashrc 中加入 GMT4 的环境变量,并使环境变量生效:

$ echo 'export GMT4HOME=/opt/GMT-4.5.17' >> ~/.bashrc
$ echo 'export PATH=${GMT4HOME}/bin:$PATH'>> ~/.bashrc
$ echo 'export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:${GMT4HOME}/lib64'>> ~/.bashrc
$ exec $SHELL -l

说明:

  • 第一个命令向 ~/.bashrc 中添加环境变量 GMT4HOME
  • 第二个命令修改 ~/.bashrc ,将 GMT4 的 bin 目录加入到 PATH
  • 第三个命令将 GMT4 的 lib 目录加入到动态链接库路径中,若为 32 位系统,则为 lib ;64 位系统则为 lib64
  • 第四个命令是重新载入 bash,相当于 source ~/.bashrc

命令测试

在终端键入 psxy - ,若出现如下输出,则安装成功:

$ psxy -
psxy 4.5.17 [64-bit] - Plot lines, polygons, and symbols on maps

个人笔记

  1. 查看 GMT 需要哪些动态链接库:

    $ cd /opt/GMT-4.5.17/bin
    $ readelf -d * | grep 'Shared library' | sort -u
    
  2. Ubuntu 下查找哪个软件包提供某个特定库文件: http://packages.ubuntu.com/

  3. CentOS 下查找哪个软件包提供某个特定库文件: yum provides libICE.so.6

修订历史

  • 2013-11-07:针对 GMT 4.5.11 发布初稿
  • 2014-03-02:针对 GMT 4.5.12 进行更新
  • 2014-03-08:make install->make install-all
  • 2014-07-10:更新 gshhg 为 2.3.1 版;GMT4 不依赖 gdal
  • 2014-09-14:更新 gshhg 为 2.3.2 版
  • 2014-09-26:Ubuntu 下 libxaw-dev 应为 libxaw7-dev
  • 2014-10-14:修正了若干细节
  • 2014-11-04:修改环境变量 LD_LIBRARY_PATH
  • 2015-01-01:更新至 GMT 4.5.13
  • 2015-09-06:推荐安装 GDAL 的 Python 绑定(内含 gdal_merge.py
  • 2015-09-18:下载后检查压缩文件的 md5 值
  • 2015-10-11:重新整理了软件的依赖关系
  • 2015-11-01:更新至 GMT 4.5.14
  • 2016-10-07:更新至 GMT 4.5.15 和 GSHHG 2.3.6
  • 2018-01-02:更新至 GMT 4.5.17 和 GSHHG 2.3.7